Do 1. ligy postoupila Příbram v sezoně 2001/02. V prvním roce skončila na devátém místě, které následně zopakovala. Po desátém místě v ročníku 2004/05 přišla nejlepší sezona v historii klubu.

Tým, v němž hráli například Martin Šlapák, Vítězslav Škácha, Jan Vošahlík, Jakub Řezníček, Tomáš Pilík nebo Matěj Štochl, dokázal v sezoně 2005/06 vybojovat konečné 4. místo, když na svém hřišti porazil všechny tři týmy, které skončily před ním – Spartu, Slavii i Olomouc.

V dalších letech už se však na tento úspěch navázat nepodařilo a tým postupně klesal tabulkou – byl 12., 13., 14., až nakonec letos skončil poslední.

29. kolo: Slavia – Ostrava 5:1 (st.) a 2:3 (ml.), Č. Budějovice – Olomouc 1:4 a 3:2, Plzeň – Ml. Boleslav 2:2 a 1:1, Most – Zlín 2:2 a 1:0, Sparta – Bohemians 1905 4:2 a 2:2, Příbram – Hr. Králové 0:2 a 2:3, Brno – Jihlava 1:3 a 1:1, Slovácko – Teplice 2:2 a 2:0. Dohrávka 26. kola: Bohemians 1905 – Č. Budějovice 5:0 a 1:3. Dohrávka 28. kola: Sparta – Jihlava 5:0 a 4:1.

Starší
1. Sparta 30 26 0 4 112:27 78
2. Olomouc 30 18 3 9 69:42 57
3. Ostrava 30 14 7 9 41:40 49
4. Ml. Boleslav 30 14 4 12 52:49 46
5. Plzeň 30 13 6 11 55:45 45
6. Slavia 30 13 6 11 60:50 45
7. Jihlava 30 12 8 10 59:61 44
8. Hr. Králové 30 12 7 11 51:48 43
9. Č. Budějovice 30 12 4 14 40:50 40
10. Teplice 30 10 9 11 45:43 39
11. Most 30 11 5 14 45:62 38
12. Slovácko 30 9 9 12 42:50 36
13. Zlín 30 10 6 14 36:49 36
14. Brno 30 10 6 14 31:49 36
15. Bohemians 1905 30 9 5 16 39:59 32
16. Příbram 30 4 1 25 25:78 13

Mladší
1. Olomouc 30 20 5 5 88:41 65
2. Slavia 30 16 8 6 64:40 56
3. Plzeň 30 15 10 5 70:39 55
4. Ostrava 30 16 7 7 51:30 55
5. Sparta 30 16 6 8 61:42 54
6. Brno 30 14 6 10 42:40 48
7. Jihlava 30 13 6 11 55:52 45
8. Ml. Boleslav 30 13 4 13 41:40 43
9. Slovácko 30 11 8 11 53:52 41
10. Č. Budějovice 30 10 7 13 30:41 37
11. Hr. Králové 30 9 8 13 51:55 35
11. Příbram 30 10 5 15 51:55 35
13. Teplice 30 10 4 16 41:53 34
14. Bohemians 1905 30 8 2 20 49:70 26
15. Most 30 6 5 19 25:70 23
16. Zlín 30 6 3 21 24:76 21